كشف تطابق التتابعات البروتينية في منطقة الشفق باستخدام تحويل فورييه
Keywords:
bioinformatics, Genetic matches, protein sequence analysis, pairwise alignment, Fourier transform, amino acid frequencies, twilight zone.Abstract
يؤدي التطابق الجيني، لاسيما بين تسلسلات الأحماض الأمينية دوراً حاسماً في مختلف مجالات البحوث البيولوجية والطبية، حيث يساعد تحديد أوجه التشابه والاختلاف بين هذه التسلسلات في فهم العلاقات التطورية والتنبؤ بوظيفة البروتينات، بالإضافة إلى أن التطابق العالي في تسلسل الحموض الأمينية المكونة للبروتينات المراد دراسة التطابق بينها يشير إلى أوجه تشابه وظيفي أو بنيوي وهو ما يمكن أن يوفر رؤى حول أدوارها البيولوجية.
نقدم في هذا البحث منهجية مقترحة تعتمد على تطبيق تحويل فورييه على تسلسل الأحماض الأمينية المكونة للبروتينات للكشف عن الأنماط وأوجه التشابه في مجال التردد وذلك من خلال تحويل ترددات ورود الأحماض الأمينية إلى المجال الترددي، حيث مكّن هذا النهج من تحديد البنى الدورية والأنماط المتكررة التي قد لا تكون واضحة في بيانات التسلسل.
تعد هذه الطريقة مفيدة بشكل خاص لتحديد أوجه التشابه البنيوية بدقة أكبر حتى عندما تكون نسبة تطابق التسلسلات منخفضة.
